Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Trappc6aQ78XR0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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