Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mfsd13aQ6PDE8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms