Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atg16l2Q6KAU8 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms