Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzrn3Q69ZS0 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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