Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtprjQ64455 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms