Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
JrkQ60976 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
JrkQ60976 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
JrkQ60976 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms