Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
DbpQ60925 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
DbpQ60925 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
DbpQ60925 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
DbpQ60925 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.6 ms