Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp48Q3V0C5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms