Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Gm28047Q3US59 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm28047Q3US59 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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