Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Usp30Q3UN04 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Usp30Q3UN04 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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