Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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