Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd11Q1RNF8 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd11Q1RNF8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2767.7 ms