Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ttc39dQ0VF76 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
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Ttc39dQ0VF76 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Ttc39dQ0VF76 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ttc39dQ0VF76 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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