Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Pik3cg-201ENSMUST00000053215 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.12
NrepQ07475 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Nlrp12-201ENSMUST00000108653 6928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Tcaf1-201ENSMUST00000045054 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
NrepQ07475 Olfr15-203ENSMUST00000214590 6240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146 ms