Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Pax5Q02650 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Pax5Q02650 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms