Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cacna1cQ01815 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms