Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Mc1rQ01727 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms