Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Vbp1P61759 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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