Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hoxd10P28359 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hoxd10P28359 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxd10P28359 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxd10P28359 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Hoxd10P28359 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd10P28359 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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