Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PdgfraP26618 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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