Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PrkcaP20444 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms