Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
NelfeP19426 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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