Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Wnk1-204ENSMUST00000088646 8364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Csn1s1P19228 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Csn1s1P19228 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms