Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
P18530 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
P18530 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
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P18530 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
P18530 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
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