Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Spi1P17433 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms