Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gstm2-202ENSMUST00000066530 854 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sptan1P16546 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms