Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Ctnnd1-202ENSMUST00000066177 5044 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Defa1P11477 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms