Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P06344 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06344 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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P06344 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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P06344 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P06344 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms