Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cfdp1O88271 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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