Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Cited2O35740 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Cited2O35740 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms