Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Casq1O09165 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Casq1O09165 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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