Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm20939L7N243 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm20939L7N243 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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