Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21818J3KMS6 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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