Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Zfp988F6VKC7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Zfp988F6VKC7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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