Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Uhrf1bp1B2KF50 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms