Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Unc13d-209ENSMUST00000174822 3337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm5592-201ENSMUST00000097044 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Trak1-211ENSMUST00000211187 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Tmem238A9JSM3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms