Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Scn3aA2ASI5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms