Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ilf3Q9Z1X4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms