Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
SrpraQ9DBG7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
SrpraQ9DBG7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms