Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccdc70Q9D9B0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccdc70Q9D9B0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccdc70Q9D9B0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccdc70Q9D9B0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc70Q9D9B0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccdc70Q9D9B0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccdc70Q9D9B0 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms