Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chmp4bQ9D8B3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms