Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trappc6bQ9D289 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms