Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Snw1Q9CSN1 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms