Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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