Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Commd4Q9CQ02 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Commd4Q9CQ02 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Commd4Q9CQ02 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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