Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gemin7-205ENSMUST00000122127 652 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Sparc-208ENSMUST00000214685 1269 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Cacna2d3-208ENSMUST00000225985 918 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprtQ99M80 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ighv1-49-201ENSMUST00000103519 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprtQ99M80 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms