Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps4Q99KG7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps4Q99KG7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms