Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
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Ddb2Q99J79 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Ddb2Q99J79 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ddb2Q99J79 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Ddb2Q99J79 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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