Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Cldn34c1Q8K193 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Cldn34c1Q8K193 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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