Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1C8

Pnma1, Paraneoplastic antigen Ma1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pnma1Q8C1C8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Pnma1Q8C1C8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Pnma1Q8C1C8 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pnma1Q8C1C8 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pnma1Q8C1C8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Pnma1Q8C1C8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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